在确定医院规划方案的过程中，总体规划具有重要意义，它可谓整个医院设计过程的重中之重。规划成功是设计成功的一半，规划的失败则意味着项目建成后会产生诸多遗憾。与此同时，我们也感到医院规划中存在不少难点。
这些难点主要包括：院区功能划分的确定；各种流线的合理规划组织；院区出入口的数量和位置的确定；医院环境与医院建筑的综合考虑。
院区功能划分的确定
在院区功能划分的过程中，首先应该确定医疗区与非医疗区的界限；第二步要把工作重心放在医疗区的规划上，进行多方案比较和探讨，最终确定一个相对合理的规划方案并加以深化；第三步是将各部门合理安排在不同功能区域内，主要是调整好各部门的相互位置关系；第四步是划分各科室的功能房间。
各种流线的合理规划组织
在复杂的医院规划中，只有组织好交通流线才能使整个医院运行得井并有条。
医院的交通流线可分为室外交通流线和室内交通流线两部分。
室外流线包括各种人流（患者、患者家属、医护人员、行政办公人员、后勤服务人员、学生等）、车流（患者私车、工作人员私车、出租车、救护车、各种货车、消防车等）、物流（药品、办公用品、食品、垃圾、尸体等）。室外流线组织的目标是使不同流线各行其道、减少交叉，与院区和建筑出入口的设计、道路设计息息相关。
室内交通流线以人流和物流为主，通过垂直交通体系（楼梯、电梯）和水平交通体系（走道、廊道）来组织。
楼梯、电梯的数量通过使用人数来计算，还必须符合防火疏散的要求。很多医院在门诊部分采用自动扶梯，符合患者就诊行为需要，使患者方便不少。垂直交通体的设置位置也相当重要，门诊大厅和周边空间的显眼位置适合设置供大量人流使用的楼梯、电梯；各功能单元交接处和端部适宜设置疏散楼梯。
每天早上是患者就医的高峰时段，也是大量工作人员的上班时间，医院的垂直交通体系在此时负担最重。如能为医护人员设置独立的垂直交通体，则可避免医患之间的相互影响，不仅在人流高峰时段提高了效率，对于医院的管理和形象塑造等也不无益处。住院部的垂直交通体以电梯为主，楼梯多作为疏散交通体。电梯应分为患者及家属专用梯、医护人员专用梯、货梯、污梯、餐梯以及专为手术室设置的电梯等。
医院的水平交通体系包括大厅、主要廊道、医院街和各种走道。门诊大厅和住院大厅都是人流汇集处，是患者就诊的开始和终点，起到重要的交通枢纽作用。医院街在我国医院建设中是比较新的概念，它在作为医院最重要水平交通体的同时囊括了多种功能，如商业、服务、体闲等。其主要目的是在为患者提供便捷交通的同时，提供多种附加服务和人文关怀，以缓解患者在就医过程中紧张、烦躁的情绪。
院区出入口数量和位置的确定
医院规划的复杂之处还在于整个医院内包含多种不同使用性质的建筑，如：医疗用房、教学科研用房、行政办公用房、后勤保障服务用房等。这些不同性质建筑的使用单位也不尽相同，包括患者、医护人员、后勤服务人员、行政管理人员、教学科研人员、学生等。同时，医院内还涉及多种物品的供应、储存和处理。例如：药品、医用耗材、办公用品、食品、普通生活垃圾、医疗垃圾、尸体等。为了满足医院内各部门的正常运行，医院规划必须做到让不同使用者各得其所，不同类型的人员、物品各行其道。因此，医院院区出入口的规划是相当重要的。
医院出入口的数量应保证各种流线尽量分开，通常不少于三个，同时还需方便管理。医院规模是影响出入口数量的因素，规模很小的医院，其功能关系往往相对简单，人流、物流量都较少，可以适当减少开口数量；大型医院则可以根据情况适当增加出入口，主要目的是分散不同性质的人流和物流，减少交叉和干扰。影响医院出入口数量和位置的因素还有场地内的环境和地形条件等。在医院出入口的规划过程中，整个院区的功能布局、环境创造和流线组织也需要同时考虑。
医院环境与医院建筑的综合考虑
环境的创造越来越受到人们的重视，这是由于环境是使用者直接感受到的周围的一切景、物、空间，它直接对人的心理产生作用。作为医院服务对象的患者由于身体上的不适，很容易产生各种消极的情绪，这就更加突显出医院环境设计的重要性。医院规划过程中主要涉及到室外环境规划，在此对于同样重要的医院室内环境创造不加赘述。
医院室外环境包括以下几个层次：门诊、急诊入口室外环境，住院部入口室外环境，大型花园和庭院，小型内庭院。
门诊、急诊入口室外环境以组织交通的广场为主，是开放的交通空间，也是患者进入医院建筑前的缓冲过渡空间。主入口广场在组织好人流、车流的同时还应在适当位置安排充足的停车空间（或结合地下停车场综合考虑）。绿化和景观小品可以丰富入口的室外空间层次，使患者感觉亲切，在情绪上也容易放松。住院部入口室外环境最好相对独立，其功能要求与门诊、急诊入口广场类似。大型花园和庭院可结合医院建筑群设计得相对完整，它为整个医院创造出一个良好的大环境，主要供住院患者日常使用，同时也为门诊患者提供舒适的环境感受。建筑之间围合出的内庭院一般更接近门诊患者，主要分布在大厅周边、候诊空间近旁和交通廊道两侧，让门诊患者能够时时处处感受到近在身边的美好自然。
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